ДНК секвенирование.

[Nova74]

Добрый день уважаемые консультанты.
1) Скажите пожалуйста, как влияет на результат секвенирование экзома предварительная консультация генетика ?

Действительно ли важны: семейная история, любые дифференциальные диагнозы и все соответствующие компоненты родительских заболеваний.
Наш прием проходил примерно так : ребенок был внешне осмотрен, мне было сказано, что видно какое-то генетическое заболевание(название не озвучено). И рекомендовано секвенирование экзома.
Изначально ребенок был госпитализирован с геморрагическим васкулитом, и после 10 дней консультаций разными специалистами по рекомендации ревматолога были направлены к генетику.
За анализ мы заплатили очень существенную для нас сумму. Результат просто шокировал. Найдено то, что видно невооруженным глазом - тугоухость, у ребенка который носит слуховые аппараты .
Изучая интернет,у меня сложилось такое понимание - при секвенирование находят множество мутаций,но имеют значение лишь те, признаки которых увидел генетик у обследуемого или родственников.(Цитата Геномеда: Чтобы определить потенциально болезнетворные варианты, к данным применяется серия фильтров, специфичных для каждого пациента.)

2) Можно пересмотреть результат секвенирование, учитывая клинику и семейный анамнез? или это новый анализ и еще 50 тысяч.

3)Выявлена мутации c.35del в гетерозиготном состоянии. Шесть лет назад это уже было обнаружено бесплатно, и тогда мне и генетик, и сурдолог сказали, что гетерозиготная мутация не может вызывать потерю слуха. это "носительство". Так ли это ?

[Nova74]

Сама нашла ответ на форуме

Сообщение от nata-k

Если точного диагноза нет, то получается, что искали иголку в стоге сена, без уверенности, что эта иголка там есть, и без уверенности, что просмотрели весь стог.

То есть, может быть нет генетической составляющей в заболевании Вашего сына, а может быть ее не нашли.

Прежде чем прибегать к каким -либо генетическим анализам надо установить диагноз с максимальной точностью.

Сообщение от nata-k

А уж в случае с такими анализами, которые больше напоминают научное исследование, а не диагностическое - назначивший врач должен провести большую работу (изучить базы данных, все возможные гены-кандидаты), посмотреть какую часть из этого выполнила лаборатория (запросить у них полные данные) и по результатам объяснить Вам какую часть "стога" удалось просмотреть.

[Nova74]

Вопрос номер 3 актуален.

[nata-k]

1. Конечно же нельзя приступать к генетическому анализу без знаний о фенотипе (внешних проявлениях).
Приступая к выполнению анализа нужно понимать на какой вопрос этот анализ призван дать ответ.
Если же анализ назначается по принципу "найди то, не знаю что" - то толку, скорее всего, будет мало.

2. Не совсем понятен вопрос. Вы считаете, что исполнители что-то не учли? Что именно?

3. В этот раз обнаружены и другие мутации. Чтобы понять на сколько они значимы, специалист должен сопоставить симптомы и результат.

И опять же, какая главная цель обследования?

[Nova74]

Спасибо за ответ

Сообщение от nata-k

И опять же, какая главная цель обследования?

Я думала,что обследование поможет найти причину геморрагической сыпи на ногах . А теперь даже и не знаю. Повторюсь,на приеме генетик мне сказала, что она видит какое-то заболевание,и ревматоголог тоже в заключении написала про множественные стигмы дизэмбриогенеза. Но что они предполагали ?

Причину сыпи врачи так и не установили. И диагнозы разные:
геморрагический васкулит; васкулит , с высокой вероятностью почечного синдрома; пурпура Шамберга.
Сын раньше жаловался, на то что ноги немеют, бегают мурашки. Ощущение как будто ноги кипятком облили.Сейчас я замечаю, что снижена чувствительность стоп. Под ногтями больших пальцев несколько раз появлялись синяки. Врач дерматолог в Москве сказал, что я наговариваю на ребенка. Максимум что может быть при болезни Шамберга-легкий зуд.
Кроме этого в моче бывают эритроциты, по УЗИ увеличенные лоханки, никтурия с 8 лет. Лишний вес, с которым боремся 4 года с переменным успехом(был гиперинсулинизм, сейчас инсулин в норме).Ангиопатия сетчатки,ВСД, ранний пубертат.

Сообщение от nata-k

2. Не совсем понятен вопрос. Вы считаете, что исполнители что-то не учли? Что именно?

я думаю, что генетик должна была поинтересоваться близкими родственниками.Наверное, я знаю немного о здоровье бабушек и дедушек и не могу судить имеет ли это значение для диагностики. Но мне было бы спокойнее,если бы я рассказала все что знаю,хотя бы касательно ног .Например ,у родственников со стороны мужа пальцы на ногах очень искривлены и сама стопа выгнута. Брат моей мамы сам себе делал уколы в ноги,была сильная боль, особенно при авиаперелетах. Мой отец и его брат рано умерли.

Болезнь Фабри исключили анализом "сухие пятна крови".Была моя тема на форуме.

[Nova74]

Скажите,пожалуйста, есть ли смысл в повторной консультации генетика если это будет другой врач, в другом городе (. Нам до Москвы 2 суток поездом.

[nata-k]

Что именно Вы называете повторной консультацией?
Вы уже получили консультацию по результату секвенирования?

[Nova74]

После получения результатов еще не было консультации. Ее я назвала повторной )

[Claudia812]

Выявлена мутации c.35del в гетерозиготном состоянии. Шесть лет назад это уже было обнаружено бесплатно, и тогда мне и генетик, и сурдолог сказали, что гетерозиготная мутация не может вызывать потерю слуха. это "носительство".

Шесть лет назад вам скорее всего (раз бесплатно) делали анализ только на мутацию с.35del гена GJB2 - самую частую мутацию при нейросенсорной несиндромальной тугоухости. Новый анализ был направлен на все мутации и подтвердил, что тугоухость Вашего сына связана с двумя патогенными мутациями гена GJB2. Каждая из этих мутаций находится в гетерозиготном состоянии, но вместе они приводят к потере функции GJB2 и тугоухости.

[Nova74]

У дочки старшей тоже тугоухость,а у меня и мужа слух нормальный.
Гены встретились ...