Саша, первое - протионамид МОЖЕТ вызывать гипотиреоз, но его у Вас нет.
Второе. И главное. Надо, очевидно, добывать картинки УЗИ, и красить стелка с цитологией по Циль-Нильсену, искать палочки. Я за 10 лет видела всего 1 случай туберкулеза щитовидной железы, и описание подходит под Ваше.

Получила результаты пункции-киста перешейка щитовидной железы.Врач сказала,чтобы я принимала йодомарин по 200.По совету Annabellы сделали посевы на туберкулез.Теперь жду.

Это НЕ результаты пункции. Для того, чтобы узнать о существовании кисты, пункция не требуется, это и так было видно по УЗИ. Какие клетки обнаружены? Какому диагнозу соответствует цитологическая картина?
Гной действительно оказался гноем или как? Туберкулезные палочки искали в мазке?

В общем, лучше бы Ваш лечащий врач задал эти вопросы цитологу. Или Вам придется забрать стекла и показать их другому специалисту.