Удалили долю щитовидной железы, размеров 5,5*5,0*3,5 см. Поверхность коричневого цвета, гладкая. На разрезе, на всём протяжении узел диаметром 4 см, в тонкой капсуле, серого цвета, с очаговыми кровоизлияниями, дольчатого вида. Перешеек размером 2,0*0,7*0,5 см., коричневого цвета, коллоидного вида.

Заключение гистологии: Гистологическое строение наиболее соответствует уартиноподобной папиллярной микрокарциноме щитовидной железы.

Хирург утверждает, что при узле 4 см невозможно заключение "Микрокарцинома", что микрокарцинома может быть только на узлах не более 1 см. и настаивает на проведении второй операции.

Помогите пожалуйста, действительно ли такое заключение не допустимо при узле 4 см?

Микрокарциномой может быть участок в узле, но в этом случае гистолог должен указать размеры.
Если весь узел 4 см представлен папиллярной карциномой - это однозначно никак не "микро". "Микро" - это действительно размер менее 1 см.

Гистолог указал что микрокарцинома, но размеры не указал. Это был пересмотр.
А первая гистология была с таким результатом: Инкапсулированная инвазивная папиллярная карцинома, фолликулярный вариант, минимально инвазивная (инвазия капсулы) 8343/3. Аутоимунный тиреодит Хашимото.

Стоит ли делать вторую операцию? Никак не можем решиться(((

При таких исходных данных вам никто не подскажет "верный ответ".
Папиллярная карцинома с размером 4 см = Т3 = удаление второй доли + супрессивная терапия тироксином + (вероятнее всего) радиойодтерапия.
Микрокарцинома (участок менее 1 см), пусть даже и минимально инвазивная и с более агрессивным гистологическим подтипом (уортиноподобный) = Т1 = живите как есть, с целевым уровнем ТТГ 0.5-2.0 мМе/л, периодической (с разумными интервалами) проверкой УЗИ, ТГ, АТ-ТГ. Правда, при сохранной доле щитовидной железы у нас нет (не существует) способов ранней диагностики прогрессирования процесса. Но и само прогрессирование весьма маловероятно.
Как выбирать? Погадать на хрустальном шаре? Монетку подкинуть?