О проблеме мушек можете прочитать здесь.
http://forums.rusmedserv.com/showthread.php?t=47819
Начинать в любом случае нужно с офтальмолога. Институт им. Гельмгольца и НИИ глазных болезней академии наук (на Россалимо) ведущие учреждения в России, потому можете обращать в любой из них.