Вот это эндокринолог сказал правильно. Рецидивы тиреотоксикоза "негативно сказываются" не только на сердце (нарушения ритма, вплоть до фатальных, развитие постоянной формы мерцательной аритмии, сердечная недостаточность), но и на прочности костей (остеопороз, переломы).
При компенсированном тиреотоксикозе (нормальный ТТГ) кофе употреблять можно (но не злоупотреблять).
Что же касается массажа и физиотерапии... то, что эти методы в Вашем случае что-то лечат - тоже заблуждение. Соответственно и вреда для щитовидной железы быть не может.