Проверил работу в Пабмеде. Данные импортируются в Менделей без каких-то проблем. HTML файла вообще нет. Кстати, даже статью в свободном доступе программа не импортирует, только библиографические данные.
Заметил, что если в выпадающем окне (после нажатия кнопки "Import to Mendeley") нажать кнопку "Save webpage snapshot", то в онлайн библиотеке действительно появляется значок якобы текста pdf, но на самом деле это как раз присоединенный "снимок" импортированной страницы в html формате. При этом если синхронизироваться с десктопом, то в десктоп-приложении все отображается корректно (значок присоединенного html файла). Добавление самих статей в библиотеку пользователя из программы, кажется, невозможно и в задачи программы не входит. Какжется, так