По поводу клинической проблемы:
(в своей практике мне не приходится работать с детьми, тем более новорожденными но несколько лет назад приходилось, правда в составе многопрофильной бригады).
Наверное нужно сделать следующее:
1. Blood culture: bacterial, viral, fungal, DNA PCR HIV (совершенно очевидно поиск этиологического агента)
2. Urine culture: bactreial, viral, fungal,
3. CAT scan (всего тела) в поисках лимфоаденопатии, специфических изменений в ЦНС (перивентирикулярных кальцификатов или как там), гидроцефалии
4. Нужно начинать лечить не дожидаясь результатов при помощи антибиотиков (цефалоспорины+ ампициллин+ ванкомицин + ацикловир)
5. Повысить калорийность питания
Ну, это так, на вскидку всеравно скоро придется вспоминать педиатрию (надеюсь, что Нельсона перечитывать не придется).