Доктор Долгова, мое скромное мнение, в Вашем изложении как-то все в кучу. Давайте попробуем немного упорядочить.

По первому случаю, Вы пишете, что пациентки была диагностирована тромбоэмболия. Был ли найден источник ? Не кажется ли Вам вероятной причной неблагоприятного исхода - рецидив тромбоэмболии в отделении (на фоне активизации). Плюс, как Вы сами пишете, имелась вторичная инфекция - почечная недостаточность на фоне сепсиса, сердечной и дыхательной недостаточности кажется вполне закономерным исходом.

По второму случаю, наверняка имелись те же предпосылки для развития почечной недостаточности: вероятно имелась инфекция, сердечная недостаточность (клиника отека легких).
Причины для развития почечной недостаточности в общем делятся на преренальные, ренальные и постренальные. Какое обследование проводилось в этом направлении и на какой версии Вы остановились ?

Сатурация артериальной крови 78 - 80% является показанием для немедленной интубации и переводу на ИВЛ.